System sądownictwa jest złożony z sądów podzielonych względem właściwości –tj. rozpoznawania spraw w określonym przedmiocie.
Sądy rejonowe
są sądami pierwszej instancji właściwymi do rozpoznawania spraw mniejszej wagi oraz o czyny zabronione zagrożone karą do 3 lat więzienia. Sądy rejonowe prowadzą również wydział ksiąg wieczystych i wydają postanowienia w sprawach o egzekucje komornicze. W Słowenii jest 44 takich sądów.
Sądy okręgowe
są sądami pierwszej instancji z zasady właściwymi do rozpoznawania spraw większej wagi i o czyny zabronione zagrożone karą więzienia powyżej 3 lat. Sądy okręgowe prowadzą również rejestr sądowy, orzekają w postępowaniach upadłościowych, sporach gospodarczych, rodzinnych, o prawa autorskie itp. W Słowenii jest 11 sądów okręgowych.
Sądy apelacyjne
rozpatrują skargi złożone na wyroki sądów pierwszej instancji. Obok orzekania w sprawie skarg na wyroki wydane przez sądy rejonowe i okręgowe właściwe miejscowo, orzekają również o ewentualnych sporach względem ich właściwości rzeczowej.
Sąd najwyższy
jest najwyższą instancją sądowniczą w Słowenii. Rozpatruje skargi nadzwyczajne w sprawach cywilnych, karnych, gospodarczych, administracyjnych, społecznych oraz związanych z prawem pracy. W większości spraw dla których jest właściwy, jest sądem trzeciej instancji, co oznacza, że rozpatruje tzw. skargi nadzwyczajne. Sąd najwyższy postanawia również w sporach pomiędzy sądami niższej instancji o właściwość, w poszczególnych sprawach również o cedowaniu na drugi sąd właściwości oraz kontroluje ewidencję orzecznictwa sądowego. Do innych zadań sądu należy też dbałość o funkcjonowanie sądów niższych instancji: prowadzenie polityki personalnej, budżetowanie placówek, informatyzacja sądów, raportowanie międzynarodowe itp.
Sądy szczególne
Działają w obszarze prawa pracy i polityki społecznej oraz administracyjnego. Sąd pracy rozpoznaje w sporach grupowych i indywidualnych. Sąd ds. społecznych orzeka w sporach społecznych, ocenia poprawność działań i wydawane przez organy właściwe rzeczowo postanowienia o prawach, obowiązkach i korzyściach prawnych wynikających z ubezpieczeń społecznych. Sąd administracyjny ma status sądu wyższej instancji i zapewnia ochronę prawną w związku z publikacją aktów prawnych.